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關稅徵收的過程是稅則歸類、稅率運用、價格審定及稅額計算的過程。進出口關稅的計算方法是：關稅稅額 = 完稅價格 * 進出口關稅稅率。進出口貨物的到、離岸價格是以外幣計算的，應由海關按照簽發稅款繳納證之日國家外匯牌價的中間價，折成人民幣。
按照規定，進口貨物的收貨人、出口貨物的發貨人、進出境物品的所有人是關稅的納稅義務人；同時有權經營進出口業務的企業也是法定納稅人。納稅人應當在海關簽發稅款繳納證的次日起七日內，向指定銀行繳納稅款；逾期不繳納的，由海關自第八天起至繳清稅款日止，按日徵收稅款總額的 1 ％的滯納金；對超過三個月仍來繳納稅款的，海關可責令擔保人繳納稅款或者將貨物變價抵繳，必要時，可以通知銀行在擔保人或納稅人存款內扣除。
關稅的退補分補徵、追徵和退稅三種情況：
1 、補徵。是指進出口貨物、進出境物品放行後，海關發現少徵或漏徵稅款時，應當自繳納稅款或者貨物、物品放行之日起一年內。向納稅義務人補徵。
2 、追徵。是指因納稅義務人違反規定而造成少徵或者漏徵的，海關在三年內可以追徵。
3 、退稅。是指海關多徵的稅款，發現後應當立即退還；納稅義務人自繳納稅款之日起一年內，可以要求海關退還，逾期不予受理。
辦理退稅時，應做到退稅依據確實，單證齊全，手續完備。納稅單位應填寫退稅申請，連同原來稅款繳納書及其他必要證件，送經原徵稅海關核實，並簽署意見，註明退稅理由和退稅金額。單位退稅，一律轉帳退付，不退現金。辦理退稅手續，除海關原因退稅外，由納稅單位向海關交納 50 元人民幣手續費。
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